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문제별 안내 · 세금·보상

직원 보상과 세제, 어떤 제도부터 볼까요

직원이 발명을 하고 회사가 성과급이나 보상을 주고 있다면, 인증과 세제를 따로 떼어 보는 것이 먼저입니다. 인증은 운영 기록을 확인받는 절차이고, 세액공제·비과세는 세법 요건을 각각 충족해야 적용됩니다.

작성 전승열 변리사 · 갱신 2026-11-08 · 공식 출처 확인일 2026-11-08

이런 회사가 이 페이지를 보면 좋습니다

  • 직원이 개발·개선한 기술로 특허를 냈거나 낼 계획이 있다
  • 발명 신고·권리 승계·보상 기록이 따로 남아 있지 않다
  • 성과급·복지 제도를 실제로 운영하고 있다
  • 연구 인력이 있지만 연구개발전담부서나 기업부설연구소 인정은 받지 않았다

패튼위드 실무 권고 · 공식 요건이 아닙니다

인증과 세제는 따로 판단합니다

이 페이지의 세제 설명은 조건부입니다. 회사가 낸 세금, 대상 인원, 지급 구조를 모른 채 절세액을 계산하지 않습니다.

조세특례제한법 제19조의 경영성과급 세액공제는 「중소기업 인력지원 특별법」에 따른 성과공유 중소기업이 상시근로자에게 경영성과급을 지급할 때 적용되며, 해당 과세연도의 상시근로자 수가 직전 연도보다 줄면 공제하지 않습니다. 성과공유 수행기관도 세제 혜택은 성과급 유형으로 확인서를 받은 경우에 해당한다고 안내합니다.

직원이 받는 직무발명보상금은 소득세법 시행령 제17조의3에 따라 연 700만원 이하 금액이 비과세됩니다. 사용자가 법인이면 지배주주등과 그 친족·경영지배관계에 있는 사람, 개인사업자면 그 친족은 제외됩니다.

지식재산처는 기업이 직무발명보상금으로 지출한 비용을 R&D 세액공제(조세특례제한법 제10조, 시행령 별표 6) 대상으로 안내합니다. 실제 적용 여부와 금액은 세무 전문가가 회사 자료로 판단합니다.

출처(확인 2026-11-08) · 국가법령정보센터 조세특례제한법 제19조 · 한국경영혁신중소기업협회(성과공유 사업수행기관) 중소기업 근로자간 성과공유제 · 국가법령정보센터 소득세법 시행령 제17조의3 · 지식재산처 지식재산권 관련 조세 지원

제도는 이렇게 이어집니다

  1. 1실제 발명과 완성 통지·권리 승계·보상규정·보상 지급 내역을 정비합니다.
  2. 2보상규정을 두고 신청일 전 2년 안에 보상한 사실이 있으면 직무발명보상 우수기업 인증을 신청할 수 있습니다.
  3. 3직무발명보상 우수기업은 성과공유도입기업 유형 가운데 중소벤처기업부 장관이 고시하는 유형에 들어 있습니다. 성과공유기업 확인은 따로 신청합니다.
  4. 4연구 인력과 공간이 있으면 연구개발전담부서 또는 기업부설연구소 인정을 검토합니다.

출처(확인 2026-11-08) · 한국경영혁신중소기업협회(성과공유 사업수행기관) 중소기업 근로자간 성과공유제 · 지식재산처 직무발명보상 우수기업 인증 · 국가법령정보센터 발명진흥법 제2조

제도별 비교

제도공식 신청 요건의 출발점혜택 구분
직무발명보상 우수기업보상규정 보유 + 신청일로부터 2년 이내 보상 사실이 있는 중소·중견기업인증(확정), 우선심사·등록료 추가 감면·사업 가점(조건부, 운영에 따라 변경 가능)
성과공유기업성과급·복지·직무발명보상 등 정해진 유형으로 근로자와 성과를 공유하는 중소기업확인(확정), 정책자금 한도 우대·병역지정 평가 반영·세액공제(조건부)
연구개발전담부서·기업부설연구소연구전담요원(전담부서 1명 이상, 연구소는 규모별)과 연구시설인정서(확정), 세액공제 등은 각 세법 요건(조건부)

출처(확인 2026-11-08) · 지식재산처 직무발명보상 우수기업 인증 · 한국경영혁신중소기업협회(성과공유 사업수행기관) 중소기업 근로자간 성과공유제 · 국가법령정보센터 기업부설연구소법 시행령 제6조

증빙 체크리스트

  • 직무발명보상규정과 직원에게 서면으로 알린 기록
  • 직무발명 완성 통지서(서면)와 승계 관련 기록
  • 보상규정에 따라 결정한 보상액을 직원에게 서면으로 알린 기록과 지급 내역
  • 특허 명의가 회사인지(대표 개인 명의면 권리관계 정리부터)
  • 성과급·복지 지급 규정과 지급 내역
  • 연구전담요원 명단, 연구 공간, 연구노트

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누가 무엇을 맡나요

대표 개인 명의 특허를 법인에 넘기는 거래는 양도대가 평가와 과세 문제가 따릅니다. 세무 검토 없이 진행하지 않습니다.

  • 변리사(패튼위드): 발명 통지·승계 절차, 보상규정의 특허 실무 부분, 인증 신청 자료
  • 노무 전문가: 보상금·성과급 지급과 급여 처리
  • 세무 전문가: 비과세·세액공제 적용 판단

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우리 회사는 어떤 제도부터 볼까요

회사명·업종·설립연도·연구 인력·보유 IP·현재 인증·최우선 과제를 입력하면 검토할 제도 후보와 부족한 증빙, 신청 시기, 담당 전문가를 바로 보여 드립니다. 무료이며 결과는 화면에서 바로 확인합니다.

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자주 묻는 질문

성과공유기업이 되면 성과급 세액공제를 받나요?

확인만으로 정해지지 않습니다. 조세특례제한법 제19조는 성과공유 중소기업이 상시근로자에게 경영성과급을 지급할 때 공제하되, 상시근로자 수가 직전 연도보다 줄면 공제하지 않습니다. 수행기관은 성과급 유형 확인서를 받은 경우에 세제 혜택이 해당한다고 안내합니다.

출처(확인 2026-11-08) · 국가법령정보센터 조세특례제한법 제19조 · 한국경영혁신중소기업협회(성과공유 사업수행기관) 중소기업 근로자간 성과공유제

대표이사가 받는 직무발명보상금도 비과세인가요?

사용자가 법인이면 지배주주등과 그 친족·경영지배관계에 있는 사람은 비과세 대상에서 제외됩니다(소득세법 시행령 제17조의3). 대주주인 대표의 보상금은 비과세를 전제로 설계하지 않습니다.

출처(확인 2026-11-08) · 국가법령정보센터 소득세법 시행령 제17조의3

직무발명보상 우수기업 인증에 보험 관련 혜택이 있나요?

지식재산처는 SGI서울보증 보험 가입 시 보험료 우대·보증한도 확대 등을 인증 혜택으로 안내합니다. SGI서울보증의 보증보험에 관한 것이며 생명보험이나 보험료 세제 혜택과는 관계가 없습니다. 혜택은 각 기관 사업 운영에 따라 바뀔 수 있습니다.

출처(확인 2026-11-08) · 지식재산처 직무발명보상 우수기업 인증

연구소가 없어도 직무발명보상 인증을 신청할 수 있나요?

지식재산처 안내상 신청 요건은 직무발명 보상규정 보유와 신청일로부터 2년 이내의 보상 사실이며, 연구소 보유는 요건으로 적혀 있지 않습니다. 심의위원회 평가 70점 이상이어야 인증됩니다.

출처(확인 2026-11-08) · 지식재산처 직무발명보상 우수기업 인증

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공식 출처

모두 2026-11-08에 직접 열어 확인한 법령 조문과 주무부처·주관기관 공고입니다. 공고와 법령은 바뀔 수 있으므로 신청 전에 최신 내용을 확인하세요.

이 글은 2026-11-08에 확인한 공식 자료를 정리한 일반 안내이며 법률·세무 자문이 아닙니다. 패튼위드는 민간 변리사 사무소이고 정부 지원사업 수행기관이 아닙니다. 선정과 혜택은 각 주관기관의 심사와 해당 연도 공고에 따르며, 세제 적용은 세무 전문가의 검토가 필요합니다.